يحقّق البرنامج جملة من الأهداف، أهمها:

  1. مواجهة المحاولات الرامية إلى التهوين من شأن القدس، وطمس معالم عروبتها، وإسلاميتها.

  2. إضافة مركز إشعاع حضاري في قلب القدس يكرّس وجهها العربيّ، والإسلاميّ الأصيل، ويبثُّ في أرجائها نور النبُّوة، وهدى الإسلام العظيم.

  3. إستقطاب طلاّب العلم من كافة أرجاء العالم ليطّلعوا بأنفسهم على شموخ حضارة الإسلام في مركز من أهم مراكز الحضارة الإسلاميّة.

  4. التّدليل على أهميّة المكانة التي تحتلها القدّس بخاصة وفلسطين بعامة في التصورات العقديّة الإسلاميّة، ومركزيتها في قلوب المؤمنين بهذه العقيدة.

  5. العمل على تجديد فكر الأمّة العربيّة والإسلاميّة، وتجديد طاقاته، وتطوير مناهجه، وربطه بالمفاهيم الإسلاميّة الأصيلة.

  6. تمكين الثقافة العربيّة والإسلاميّة من استيعاب الأصول الإسلاميّة، والتراث الإسلاميّ، فضلا عن العلوم، والمعارف الحديثة، وتيسيرها على الدّارسين المسلمين.

  7. تفهّم طبيعة أزمة الفكر الإسلاميّ المعاصر، وأسبابها مع دراسة السّبل، والوسائل الكفيلة بالتغلّب عليها، ومواجهة آثارها.

  8. العمل على بحث القضايا المعاصرة؛ المحليّة، والعربيّة والإسلاميّة، والإنسانيّة المشتركة من منطلقات إسلاميّة.

  9. إجراء دراسات، وأبحاث منهجيّة بقصد غرس المفاهيم، والتطلّعات الإسلاميّة، وإرساء قاعدة للعلوم الاجتماعيّة، والإنسانيّة الإسلاميّة.