تقوم فلسفة البرنامج على تقديم برنامج ماجستير في العلوم الطبية المخبرية يتناغم  مع سياسة الدراسات العليا في الجامعة. ولذلك فان هدف البرنامج هو توفير برنامج تعليمي عالٍ ومتخصص في مجال العلوم الطبية المخبرية يوفر بيئة تعليمية ذات مهنية عالية وكذلك توفير التسهيلات اللازمة لإجراء الأبحاث العلمية التطبيقية، والتي تعمل على إكساب طلبة البرنامج المهارات العلمية والعملية والبحثية التي تؤهلهم للمساهمة في رفع مستوى وقيادة التطوير في مجال الخدمات الطبية المخبرية وكذلك تنشيط البحث العلمي وتوظيفه لخدمة ومعالجة المشاكل الطبية ذات الإهتمام المحلي وكذلك ذات الاهتمام العلمي العام.